En el documento se presenta una versión revisada y ampliada de una matriz de evaluación cualitativa para la evaluación de los potenciales de los servicios del ecosistema, elaborada en 2009. La matriz es una herramienta que califica los tipos de ecosistemas terrestres, costeros y marinos con respecto a sus capacidades para proporcionar servicios ecosistémicos de aprovisionamiento, regulación y culturales, así como indicadores del estado del ecosistema mediante la aplicación de criterios de integridad del ecosistema. Se describen los pasos metodológicos del desarrollo de la matriz, y las opiniones de expertos emergentes se ilustran caracterizando diferentes tipos de ecosistemas, analizando diferentes servicios del ecosistema y mostrando los resultados de los ejercicios de mapeo basados en SIG vinculados. La aplicabilidad de la matriz queda demostrada por algunos casos de estudio. Las incertidumbres relacionadas se caracterizan y discuten en contexto con limitaciones, desafíos que surgen y problemas conceptuales. La herramienta está disponible en internet.